Les fabricants d'aliments ont mis en place une traçabilité qui permet de connaître les origines et les caractéristiques des matières premières utilisées, à partir du numéro de lot, présent sur chaque bon de livraison remis au pisciculteur.
De plus, la réglementation sur l'étiquetage des aliments pour poisson prévoit de faire figurer sur l'emballage, la liste détaillée des ingrédients.
Comme tous les aliments, les aliments pour poisson doivent répondre à des obligations générales de qualité et de sécurité contrôlées par la DGCCRF (Direction Générale de la concurrence, de la consommation et de la répression des fraudes).
Enfin, les chercheurs mènent des études pour obtenir une digestibilité optimale des aliments afin d'améliorer les performances d'élevage et de limiter les rejets dans l'environnement.